GSE38481 GSE38484 whole blood schizophrenia metadata

fact GEO SuperSeries 的独立队列假象 组学数据库检索的实体层级校验 精神分裂症外周血转录组免疫衰老题眼

修改:20260516201612000

GSE38481 与 GSE38484 的关键元数据


GSE38481GSE38484 都是 schizophrenia 的 human whole blood 表达数据,且都属于 GSE38485 的 SubSeries,而不是可直接并列统计的独立 SuperSeries 队列。

可复用的元数据结论


* GSE38481:37 个样本,平台 GPL6883,status 22 CONTROL / 15 schizophrenia (SCZ),样本级字段包含 age、gender、status、tissue;tissue 为 Whole blood。
* GSE38484:202 个样本,平台 GPL6947,status 96 CONTROL / 106 schizophrenia (SCZ),样本级字段包含 age、gender、status、tissue;tissue 为 whole blood。
* 配对校验:37 + 202 = 239,等于 GSE38485 SuperSeries 样本总量;合并疾病分组为 118 CONTROL / 121 SCZ。

层级关系


GSE38485 是容器层 SuperSeries;GSE38481GSE38484 是其下两个 SubSeries/平台层证据。引用时应优先把具体样本量、平台、phenotype 字段落到子系列;只有在说明去重、总样本量或 GEO 层级边界时才引用 GSE38485

年龄校验与使用边界


年龄题眼的分组覆盖与混杂校验 给出的年龄证据要求收缩用法:两个子系列 age 字段均 100% 覆盖,病例/对照均值差小(GSE38481 约 1.42 岁,GSE38484 约 0.27 岁),适合做连续年龄协变量或年龄调整;但老年尾部很薄(GSE38481 >=60 岁 2/37,GSE38484 >=60 岁 11/202,>=55 岁 26/202),不适合把老年/免疫衰老分层作为主分析。

对题眼的含义


这两个子系列足以支持一个以 whole blood 横断面对照为主的题眼;但仅凭当前 series_matrix 头部,还不能支撑用药、治疗反应或纵向变化作为主问题。因此若题眼要围绕 精神分裂症外周血转录组免疫衰老题眼 继续推进,应把疾病状态与年龄协变量作为主轴,并避免把 GSE38485 与其两个子系列重复计数。