GDS 检索命中的实体类型过滤

API 原始响应的结构化摘要输出 GDS UID 与 GEO accession 的区分 method lesson GDS 检索命中的实体类型过滤 样本来源词不能替代组学模态约束 Entrez ESearch 原始响应与 TranslationSet 复核

修改:20260511180133000

在 NCBI GDS/db=gds 中,ESearch/ESummary 命中可能混有 GSE/GDS/GSM/GPL 等实体;枚举可分析队列时,应先用 accession 前缀或 DocSum 类型只保留目标实体层级,再做疾病、样本来源和模态校验。这个门禁应与 GDS UID 与 GEO accession 的区分 同时执行,否则平台注释或样本记录会被误当成候选数据集。

续写 · Iter-0518


在 NCBI GDS 中,ETYP 的 EInfo 定义是 Entry Type(DataSet/Series),不能用 expression profiling by array[ETYP] 来约束实验模态;模态过滤应另查 PTYP/GTYP/DESC 或回到记录级元数据复核。每次字段语义可疑时,应按 Entrez ESearch 原始响应与 TranslationSet 复核 先看 EInfo/TranslationSet,再把 GDS 检索命中的实体类型过滤 与样本来源、组学模态约束分开处理。