生信投稿管线的可复现清单门槛

面向可投稿生信论文时，reproducibility manifest 不能只列“将要分析什么”，而应把每个脚本映射到输入、输出、验收条件、稿件表/图位置和失败降级规则。最小门槛包括：

- ≥4 个可执行脚本，按数字前缀排序，覆盖下载、资源冻结、表达矩阵处理、评分/建模、出图出表和 session capture；
- ≥3 个 source-data 表和 ≥4 个图件，每个都有明确文件名和 manuscript section 映射；
- 对关键远程输入做一次轻量经验性探针（如 HTTP Range 读取 GEO matrix 前若干字节），避免把不可达 URL 写进方案；
- session_info.json 与 hash manifest 是必需输出，覆盖原始输入、冻结 gene-set、脚本、表和图；
- 每个脚本写明 pass/fail acceptance check，失败时按预设规则降级，不允许事后围绕显著性改主张。

这条原则与 通路评分的基因集出处门槛 配套：gene-set 资源要可追溯，整条管线也要可重跑；也与 GEO 预处理状态三角校验 配套：预处理判断必须落到可执行 QC 表，而不是停留在文字说明。